Expasy

Expasy est une ressource bioinformatique en ligne exploitée par le SIB Institut suisse de bioinformatique . Il s'agit d'un portail extensible et intégratif qui donne accès à plus de 160 bases de données et outils logiciels et prend en charge une gamme de domaines de recherche clinique et des sciences de la vie, de la génomique , de la protéomique et de la biologie structurale à l'évolution et à la phylogénie , à la biologie des systèmes et à la chimie médicale . Les ressources individuelles (bases de données, outils logiciels Web et téléchargeables) sont hébergées de manière décentralisée par différents groupes du SIB Institut suisse de bioinformatique et des institutions partenaires.

Les requêtes d'Expasy permettent :

1. recherches parallèles dans les bases de données SIB via une recherche unique
2. résultats de recherche agrégés à partir de l'ensemble complet de >160 ressources accessibles depuis le portail.

Expasy fournit des informations à jour à partir de la version la plus récente de chaque ressource.

Les termes utilisés dans Expasy sont basés sur l' ontologie complète EDAM .

Expasy a été créé en août 1993. À l'origine, il s'appelait ExPASy ( Expert Protein Analysis Sy stem) et servait de serveur de protéomique pour analyser les séquences et les structures des protéines et l'électrophorèse sur gel bidimensionnelle (électrophorèse 2D Page). [ 3 Entre autres, ExPASy hébergeait la base de connaissances sur les séquences de protéines, UniProtKB/Swiss-Prot , et son supplément annoté par ordinateur, UniProtKB/TrEMBL.

ExPASy a été le premier site Internet consacré aux sciences de la vie et l'un des 150 premiers sites Internet au monde. Au 5 avril 2007 , ExPASy avait été consulté 1 milliard de fois depuis son installation le 1er août 1993.

En juin 2011, il est devenu le portail de ressources bioinformatiques SIB ExPASy : un catalogue diversifié de ressources bioinformatiques développées par les groupes SIB. La version actuelle d'Expasy a été publiée en octobre 2020.