Worldlex Wiki La base de données Molecular Ancestry Network (MANET) est une base de données bioinformatique qui cartographie les relations évolutives des architectures protéiques directement sur les réseaux biologiques. Elle a été initialement développée par Hee Shin Kim, Jay E. Mittenthal et Gustavo Caetano-Anolles au Département des sciences des cultures de l' Université de l'Illinois à Urbana-Champaign .
MANET retrace par exemple l'ascendance des enzymes métaboliques individuelles dans le métabolisme avec des méthodes bioinformatiques, phylogénétiques et statistiques. MANET relie actuellement les informations de la base de données SCOP (Structural Classification of Proteins ), la base de données des voies métaboliques de l'Encyclopédie des gènes et génomes de Kyoto ( KEGG ) et les reconstructions phylogénétiques décrivant l'évolution de l'architecture des replis protéiques à un niveau universel. La base de données a été mise à jour pour refléter l'évolution du métabolisme au niveau des familles de replis protéiques. MANET « peint » littéralement les ascendances des enzymes dérivées d'arbres phylogénétiques enracinés directement sur plus d'une centaine de représentations de voies métaboliques, rendant hommage à l'un des pères de l'impressionnisme . Il fournit également de nombreuses fonctionnalités qui permettent de rechercher des replis protéiques spécifiques avec des valeurs d'ascendance définies, d'afficher la distribution des enzymes peintes et d'explorer les détails quantitatifs décrivant les replis protéiques individuels. Cela permet l'étude des architectures de réseaux métaboliques globaux et locaux et l'extraction de modèles évolutifs aux niveaux global et local.
Une analyse statistique des données de MANET a montré par exemple une distribution inégale des valeurs d'ascendance attribuées aux replis protéiques dans chaque sous-réseau, indiquant que l'évolution du métabolisme s'est produite à l'échelle mondiale par un recrutement généralisé d'enzymes. MANET a été utilisé récemment pour trier les processus de recrutement enzymatique dans les réseaux métaboliques et proposer que le métabolisme moderne trouve son origine dans le sous-réseau métabolique des nucléotides puriques . l'évolution métabolique .