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Un microaérophile est un micro-organisme qui nécessite , pour une croissance optimale, un environnement contenant moins de dioxygène que l' atmosphère (c.-à-d. < 21 % d'O₂ ; généralement 2 à 10 % d'O₂ ) . Une interprétation plus restrictive exige que le micro-organisme soit strictement nécessaire à cette condition. De nombreux microaérophiles sont également capnophiles , nécessitant une concentration élevée de dioxyde de carbone (p. ex. 10 % de CO₂ chez les espèces de Campylobacter ).
La définition initiale de microaérophile a été critiquée pour son caractère trop restrictif et son manque de précision par rapport à des catégories similaires. Le terme plus général de microaérobie a été créé pour décrire les microbes capables de respirer l'oxygène « dans des environnements microoxiques grâce à une oxydase terminale à haute affinité ».
Culture
Les microaérophiles sont traditionnellement cultivés dans des bocaux à bougie. Ces bocaux sont des récipients dans lesquels on introduit une bougie allumée avant de fermer hermétiquement le couvercle . La flamme de la bougie brûle jusqu'à s'éteindre par manque d'oxygène, créant ainsi une atmosphère riche en dioxyde de carbone et pauvre en oxygène.
Les nouvelles méthodes de bioréacteurs à oxystat permettent un contrôle plus précis des niveaux de gaz dans le milieu microaérobie, grâce à une sonde mesurant en temps réel la concentration en oxygène ou le potentiel redox. Le contrôle de l'apport en oxygène peut être assuré par des générateurs de gaz ou par des échanges gazeux.
Les bioréacteurs à oxystat étant coûteux à l'achat et à l'utilisation, des solutions moins onéreuses ont été mises au point. Par exemple, le dispositif de culture micro-oxygénée (MOCD) est un système composé de flacons ordinaires, de tubes perméables à l'oxygène, de capteurs et de pompes à eau. L'aération est réalisée par pompage du milieu de culture à travers les tubes.
Exemples
Il existe dans le monde une grande variété de conditions microaérobies : dans le corps humain, sous l'eau, etc. De nombreuses bactéries provenant de ces sources sont des microaérobes, dont certaines sont également des microaérophiles.
- Certains membres des Campylobacterales sont microaérophiles :
- Les espèces de Campylobacter sont microaérophiles.
- Helicobacter pylori (anciennement identifié comme un Campylobacter ), une espèce de Campylobacterota qui a été liée aux ulcères peptiques et à certains types de gastrite
- De nombreux membres du genre Lactobacillus sensu lato (voir Lactobacillaceae ) sont microaérophiles. En tant qu'anaérobies facultatifs, ils survivent dans des conditions anaérobies, mais se développent mieux avec un peu d'oxygène.
- Magnetospirillum gryphiswaldense et des bactéries magnétotactiques microaérophiles aquatiques . La formation de magnétite chez ces bactéries nécessite généralement des conditions microaérobies.