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Authorea est un outil d'écriture collaborative en ligne qui permet aux chercheurs d'écrire, de citer, de collaborer, d'héberger des données et de publier. Il a été décrit comme ...

Authorea est un outil d'écriture collaborative en ligne qui permet aux chercheurs d'écrire, de citer, de collaborer, d'héberger des données et de publier. Il a été décrit comme « Google Docs pour les scientifiques ». Il appartient à la société d'édition commerciale Wiley via Atypon depuis 2018.

Aperçu

Authorea permet aux chercheurs de rédiger des documents ensemble et d'y joindre des références, des figures, des données et du code source. Les fonctionnalités de l'outil comprennent l'édition collaborative (plusieurs personnes éditant un document en même temps), la mise en forme automatique des citations, le suivi des modifications et la possibilité de rendre tout document public ou entièrement privé.

Lorsqu'il est utilisé comme outil d'édition pour les articles scientifiques , Authorea formatera automatiquement un article dans le style préféré et fournira des fichiers adaptés à la soumission en ligne à des revues et conférences évaluées par des pairs . Plus de 40 styles spécifiques aux éditeurs et aux revues sont actuellement pris en charge.

Authorea fait partie du mouvement de la science ouverte et soutient la publication en libre accès pour la recherche universitaire et l'accès gratuit aux données de recherche . La version gratuite du service permet un accès illimité aux documents publics, un espace de stockage public (pour les figures, les données, le code et d'autres documents de support) et un nombre illimité de collaborateurs (co-auteurs) par document. Les documents publics sont accessibles gratuitement à tous.

Authorea prend également en charge l'écriture privée : un document et toutes ses pièces jointes peuvent être conservés privés, visibles uniquement par les co-auteurs. Un compte gratuit permet à l'utilisateur de créer un document privé gratuit, d'autres étant disponibles via un abonnement payant.

Authorea prend également en charge les flux de travail de pré-impression. Authorea s'est associé à bioRxiv pour permettre aux auteurs de soumettre des pré-impressions directement à bioRxiv depuis Authorea en 2017. De plus, la plateforme d'hébergement de révision de pré-impression PREreview a été construite à l'aide de l'infrastructure technique d'Authorea.

Le site prend actuellement en charge un éditeur LaTeX en ligne ainsi qu'un éditeur Markdown (wiki). Une interface simple de type MS Word ( WYSIWYG ) est actuellement en cours de développement.

Authorea est passé de plus de 10 000 utilisateurs actifs en 2014 à plus de 50 000 en 2016.

Histoire

Authorea a été lancé en février 2013 par les cofondateurs Alberto Pepe et Nathan Jenkins et le conseiller scientifique Matteo Cantiello, qui se sont rencontrés alors qu'ils travaillaient au CERN . Ils ont reconnu des difficultés communes dans le processus de rédaction et de publication de travaux universitaires. Pour résoudre ces problèmes, Pepe et Jenkins ont développé un éditeur en ligne basé sur le Web pour soutenir la rédaction collaborative en temps réel, ainsi que le partage et l'exécution des données et du code de recherche. Jenkins a terminé la création du premier prototype de site en moins de trois semaines.

Après avoir travaillé pendant près de deux ans, Pepe et Jenkins ont développé Authorea en contactant des amis et des collègues, en intervenant lors d'événements et de conférences et en s'associant à des institutions pionnières.

En septembre 2014, Authorea a annoncé la clôture réussie d'un tour de financement d'amorçage de 610 000 $ auprès des groupes New York Angels et ff Venture Capital . En janvier 2016, Authorea a clôturé un tour de financement de 1,6 million de dollars mené par Lux Capital et incluant la Knight Foundation et Bloomberg Beta. The Winnower, soutenue par le capital-risque .

En 2018, Authorea a été acquis pour un montant non divulgué par Atypon (qui fait partie de Wiley).

Liste des fonctionnalités

La plateforme Authorea prend en charge un certain nombre de fonctionnalités pertinentes pour la rédaction académique.

Collaboration

  • Écriture collaborative – Plusieurs utilisateurs peuvent modifier un document en même temps
  • Commentaires – Les sections du document et le texte mis en surbrillance peuvent être annotés avec des commentaires publics ou privés
  • Chat en direct dans l’article – Les co-auteurs peuvent discuter en ligne tout en écrivant
  • Suivi des modifications – L’historique complet du document est suivi avec Git ; les modifications individuelles peuvent être examinées et annulées

Formatage et citations

  • Recherche de citations – La recherche de citations intégrée permet d'ajouter des citations complètes directement à partir de PubMed et CrossRef, ou à partir du DOI d'un article
  • Formatage des références – Authorea formate automatiquement les références d’une publication cible lors de l’exportation
  • Styles d’éditeur – Plus de 40 modèles de styles d’éditeur et de revue sont pris en charge
  • Équations – Authorea prend en charge les équations écrites dans le balisage LaTeX

Contenu riche

  • Figures – Glissez-déposez les figures directement dans un document ou téléchargez-les à partir d’un dossier
  • Publication de données – Des fichiers de données brutes et des notebooks iPython peuvent être joints aux figures
  • Code source en direct – Authorea fournit un serveur iPython Notebook en direct pour ouvrir et exécuter les notebooks iPython attachés. Permet les calculs et l'analyse des données
  • Figures interactives – Authorea prend en charge les figures interactives à l’aide de D3.js

Exporter et importer

  • GitHub et édition hors ligne – Les documents et les fichiers sont stockés dans des référentiels Git sur les serveurs Authorea. Chaque document peut être synchronisé avec un compte GitHub pour une édition et une sauvegarde hors ligne
  • Exportation – Les formats d’exportation Word, PDF et LaTeX sont pris en charge
  • Importer – Les utilisateurs peuvent importer un fichier LaTeX ou .docx pour créer un nouveau document Authorea

Architecture technique

Authorea est principalement construit avec Ruby on Rails , et les documents et fichiers sont stockés dans des dépôts Git . Resque et Faye sont également utilisés.

Le site prend en charge les blocs-notes iPython et exécute un serveur de blocs-notes iPython en direct, afin que les utilisateurs puissent joindre, réexécuter et reproduire des calculs scientifiques et des analyses de données directement dans un document Authorea.

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