Pospiviroïdes

Les Pospiviroidae sont une famille incertae sedis de viroïdes à ARN simple brin avec 5 genres et 39 espèces , y compris le premier viroïde à avoir été découvert, PSTVd , qui fait partie du genre Pospiviroid . Leur structure secondaire est la clé de leur activité biologique . La classification de cette famille est basée sur des différences dans la séquence conservée de la région centrale. des Pospiviroidae se produit de manière asymétrique via l'ARN polymérase , l'ARNase et l'ARN ligase de la cellule hôte . Ses hôtes sont des plantes , en particulier des dicotylédones et certaines monocotylédones . La gravité de l'infection peut varier de l'absence d'effet à des dommages dévastateurs et généralisés pour une population. Cela peut également dépendre de la combinaison virus-hôte.

Les membres de la famille Pospiviroidae possèdent un ARNss circulaire de 246 à 375 nt. Ils adoptent des conformations en forme de bâtonnet ou de quasi-bâtonnet contenant une région centrale conservée (CCR) et une épingle à cheveux terminale conservée (TCH) ou une région terminale conservée (TCR). Le génome des viroïdes ne code aucune protéine.

Sa réplication est nucléaire et médiée par l'ARN polymérase II dépendante de l'ADN, qui est redirigée pour utiliser des modèles d'ARN via un mécanisme de cercle roulant ARN-ARN asymétrique. Les molécules d'ARN circulaire de polarité (+) (par convention, le brin le plus abondant in vivo ) sont transcrites de manière répétée en ARN complémentaires oligomériques (−). Ces intermédiaires servent de modèles pour générer des ARN oligomériques (+) qui sont clivés par une enzyme hôte de la classe RNase III. Les extrémités des monomères linéaires résultants sont ligaturées par l'ADN ligase 1 de l'hôte pour générer l'ARN viroïde circulaire mature.

Apscaviroid

Cocadviroïde

Coléviroïde

Hostuviroïde

Pospiviroïde