Micrococcus est un genre de bactéries de la famille des Micrococcaceae . Micrococcus est présent dans une grande variété d'environnements, notamment l'eau, la poussière et le sol. Les microcoques ont des cellules sphériques Gram positives dont le diamètre varie d'environ 0,5 à 3 micromètres et apparaissent généralement en tétrades. Elles sont catalase positive, oxydase positive, indole négative et citrate négative. Micrococcus a une paroi cellulaire importante, qui peut représenter jusqu'à 50 % de la masse cellulaire. Le génome de Micrococcus est riche en guanine et cytosine (GC), présentant généralement une teneur en GC de 65 à 75 % . Les microcoques portent souvent des plasmides (d'une taille allant de 1 à 100 MDa) qui confèrent à l'organisme des caractéristiques utiles.
Certaines espèces de Micrococcus , comme M. luteus (jaune) et M. roseus (rouge), produisent des colonies jaunes ou roses lorsqu'elles sont cultivées sur gélose au mannitol et au sel. On a constaté que les isolats de M. luteus surproduisaient de la riboflavine lorsqu'ils étaient cultivés sur des polluants organiques toxiques comme la pyridine.
Taxonomie
Des études d'hybridation menées en 1995 indiquent que les espèces du genre Micrococcus ne sont pas étroitement liées, ne présentant qu'une similarité de séquence de seulement 50 % . Cela suggère que certaines espèces de Micrococcus pourraient, sur la base d'une analyse de l'ARN ribosomique , être éventuellement reclassées dans d'autres genres microbiens.
Les espèces suivantes ont été reclassées depuis :
- "M. amylovorus" → Erwinia amylovora .
- « M. calcoaceticus » → Acinetobacter calcoaceticus .
- « M. cinereus » → Neisseria cinerea .
- "M. agilis" → Arthrobacter agilis .
- « M. denitrificans » → Paracoccus denitrificans
- "M. fulvus" → Myxococcus fulvus .
- "M. gallicidus" → Pasteurella multocida .
- "M. glutamicus" → Corynebacterium glutamicum .
- « M. halobius » → Nesterenkonia halobia .
- « M. halodenitrificans » → Halomonas halodenitrificans .
- « M. hyicus » → Staphylococcus hyicus .
- "M. indolicus" → Peptoniphilus indolicus .
- "M. kristinae" → Rothia kristinae .
- "M. lactis" → Néomicrococcus lactis .
- "M. meningitidis" → Neisseria meningitidis .
- « M. mucilaginosus » → Rothia mucilaginosa .
- « M. niger » → Peptococcus niger .
- « M. nishinomiyaensis » → Dermacoccus nishinomiyaensis .
- « M. nitrosus » → Nitrosococcus nitrosus .
- "M. pelletieri" → Actinomadura pelletieri .
- « M. phosphoreus » → Photobacterium phosphoreum .
- « M. pneumoniae » → Streptococcus pneumoniae .
- "M. prevotii" Foubert et Douglas 1948 → Anaerococcus prevotii .
- « M. roseus » → Kocuria rosea .
- « M. saccharolyticus » → Staphylococcus saccharolyticus .
- "M. sedentarius → Kytococcus sedentarius .
- « M. subflavus » → Neisseria subflava .
- « M. varians » → Kocuria varians
Les noms suivants n'ont pas été inclus dans les listes approuvées de 1980 :
- "M. candicans"
- « M. cryophilus »
- « M. diversus »
- « M. prodigiosus »
- « M. radiodurans »
- « M. radioproteolyticus »
- "M. sodonensis"
De plus, la GTDB (révision 214) indique que Micrococcus terreus appartient probablement à Citricoccus .
Environnement
Les microcoques ont été isolés de la peau humaine, des produits animaux et laitiers et de la bière. On les trouve dans de nombreux autres endroits de l'environnement, notamment dans l'eau, la poussière et le sol. M. luteus sur la peau humaine transforme les composés de la sueur en composés à l' odeur désagréable . Les microcoques peuvent bien se développer dans des environnements avec peu d'eau ou des concentrations élevées de sel, y compris les vêtements de sport fabriqués avec des tissus synthétiques . La plupart sont mésophiles ; certains, comme Micrococcus antarcticus (présent en Antarctique) sont psychrophiles .
Bien qu'elles ne forment pas de spores , les cellules de Micrococcus peuvent survivre pendant une période prolongée, à la fois à des températures de réfrigération et dans des conditions pauvres en nutriments, comme lorsqu'elles sont scellées dans de l'ambre .
Pathogénèse
Micrococcus est généralement considéré comme un organisme saprotrophe ou commensal , bien qu'il puisse être un pathogène opportuniste , en particulier chez les hôtes dont le système immunitaire est affaibli , comme les patients atteints du VIH . Il peut être difficile d'identifier Micrococcus comme la cause d'une infection, car l'organisme est normalement présent dans la microflore cutanée et le genre est rarement lié à la maladie. Dans de rares cas, le décès de patients immunodéprimés est survenu à la suite d'infections pulmonaires causées par Micrococcus . Les microcoques peuvent être impliqués dans d'autres infections, notamment la bactériémie récurrente, le choc septique, l'arthrite septique, l'endocardite, la méningite et la pneumonie caverneuse (patients immunodéprimés).
Utilisations industrielles
Les microcoques, comme de nombreux autres représentants des Actinobactéries, peuvent être polyvalents sur le plan catabolique , avec la capacité d'utiliser une large gamme de substrats inhabituels, tels que la pyridine , les herbicides , les biphényles chlorés et l'huile . Ils sont probablement impliqués dans la détoxification ou la biodégradation de nombreux autres polluants environnementaux. D'autres isolats de Micrococcus produisent divers produits utiles, tels que les hydrocarbures aliphatiques à longue chaîne (C21-C34) pour les huiles lubrifiantes.