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TSHZ1

Localisation des gènes ( Souris ) Chr. Chromosome 18 (souris) Groupe 18 E4|18 57,53 cM Commencer 84 029 752 pb Fin 84 105 831 pb Modèle d'expression de l'ARN Bgee Humain Souris ...

Localisation des gènes ( Souris )
Chromosome 18 (souris)
Chr.Chromosome 18 (souris)
Chromosome 18 (souris)
Localisation génomique du gène TSHZ1
Localisation génomique du gène TSHZ1
Groupe18 E4|18 57,53 cMCommencer84 029 752 pb
Fin84 105 831 pb
Modèle d'expression de l'ARN
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Haut exprimé en
  • muqueuse jéjunale

  • vermis cérébelleux

  • muqueuse de l'iléon

  • Zone Brodmann 23

  • cellule endothéliale

  • cellule épithéliale pancréatique

  • cortex visuel primaire

  • tête de l'épididyme

  • gyrus temporal moyen

  • myocarde du ventricule gauche
Haut exprimé en
  • Courant migratoire rostral

  • bulbe olfactif

  • épithélium olfactif

  • cellule de la crête neurale entérique migratrice

  • cellule cumulus

  • zygote

  • paroi abdominale

  • membrane vestibulaire du canal cochléaire

  • corps ciliaire

  • tubercule olfactif
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n / A
Ontologie des gènes
Fonction moléculaire
  • Liaison ADN
  • liaison d'ions métalliques
  • liaison de la chromatine
  • Activité répressive de la transcription liée à l'ADN, spécifique de l'ARN polymérase II
  • liaison d'acide nucléique
  • Activité du facteur de transcription de liaison à l'ADN, spécifique de l'ARN polymérase II
Composant cellulaire
  • noyau
Processus biologique
  • développement du palais mou
  • régulation de l'expression des gènes
  • régulation de la transcription, basée sur l'ADN
  • transcription, basée sur un modèle d'ADN
  • spécification du motif antérieur/postérieur
  • morphogenèse de l'oreille moyenne
  • développement d'organismes multicellulaires
  • régulation de la transcription par l'ARN polymérase II
  • régulation négative de la transcription par l'ARN polymérase II
Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHumainSouris
Entrez

10194

110796

Ensemble

ENSG00000179981

ENSMUSG00000046982

UniProt

Q6ZSZ6

Q5DTH5

RefSeq (ARNm)

NM_001308210
NM_005786

NM_001081300
NM_001364993
NM_001364994

RefSeq (protéine)

NP_001295139
NP_005777
NP_005777.3

NP_001074769
NP_001351922
NP_001351923

Localisation (UCSC)Chr 18: 75.21 – 75.29 MoChr 18: 84.03 – 84.11 Mo
Recherche PubMed
Wikidata
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Teashirt zinc finger homeobox 1 est une protéine qui, chez l'homme, est codée par le gène TSHZ1 .

Fonction

Ce gène code un antigène du cancer du côlon qui a été défini par analyse sérologique de bibliothèques d'expression d'ADNc recombinant. La protéine codée est un membre de la famille des protéines à doigt de zinc de type C2H2 de la famille des teashirt et pourrait être impliquée dans la régulation transcriptionnelle des processus de développement. Les mutations de ce gène pourraient être associées au syndrome d'atrésie auriculaire congénitale .

Dans les modèles animaux

Outre les humains, on sait que des gènes orthologues de la famille Tshz existent chez plusieurs autres organismes, notamment des invertébrés comme les insectes. Les recherches utilisant des organismes modèles peuvent être extrêmement bénéfiques pour explorer la fonctionnalité potentielle des gènes présents chez les humains sans nécessiter de tests sur les humains. De plus, en examinant les changements de nombre et de fonction des gènes entre des organismes présentant différents niveaux de parenté, il est possible de mieux comprendre la phylogénie du gène , ou son histoire évolutive. Les découvertes liées aux orthologues de Tshz1 dans les organismes modèles varient en termes d'échelle et de densité de recherche d'un organisme à l'autre.

Chez la souris

Les souris sont couramment utilisées pour étudier la fonctionnalité de Tshz1 en raison de leur plus grande parenté avec les humains en tant que mammifères par rapport à d'autres organismes modèles courants. Cependant, les gènes Tshz1 dans les organismes mammifères non modèles ont été caractérisés ou explorés en détail, dans une mesure limitée. L'orthologue Tshz1 dans le modèle de souris Mus musculus a été impliqué dans le développement des motoneurones et la morphogenèse craniofaciale. Des expériences impliquant l'inactivation totale du gène Tshz1 pendant le développement ont entraîné une létalité universelle des chiots M. musculus peu après la naissance, probablement en raison de défauts du palais mou et de déformations squelettiques liés à l'inactivation de Tshz1. Des souris mutantes dans des expériences d'inactivation et de perte de fonction se sont révélées incapables de téter et de se nourrir, leurs intestins se remplissant d'air peu après la naissance et leur estomac apparaissant distendu par rapport aux individus de type sauvage . Les recherches sur l'impact de Tshz1 sur le développement des motoneurones ont été limitées en échelle, cependant il a été observé que les souris mutantes Tshz1 ont des difficultés à réguler la respiration, en raison d'une diminution de la survie du nerf hypoglosse et des motoneurones phréniques au cours du développement.

Chez le poisson zèbre

Les orthologues de Tshz1 chez Danio rerio n'ont pas encore été caractérisés en grande partie, mais des expériences utilisant l'hybridation in situ pour marquer l'expression des gènes ont montré que Tshz1a est le plus fortement exprimé dans la moelle épinière, le cerveau antérieur et postérieur et l'œil au cours du développement précoce. Par conséquent, on soupçonne que Tshz1a pourrait jouer un rôle dans le développement des neurones dans le cerveau et le système visuel, y compris la rétine. Trois autres gènes de la famille Tshz sont connus pour exister chez le poisson zèbre : Tshz2, Tshz3a et Tshz3b. Un cinquième gène, Tshz1b, devrait exister. Plusieurs versions du même gène existent couramment dans le génome du poisson zèbre, appelées « a » et « b », en raison d'un événement évolutif connu sous le nom de WGD (Whole Genome Duplication) dans la lignée ancestrale des poissons téléostéens , auxquels appartient le poisson zèbre. L’existence potentielle de Tshz1b dépend donc du fait que l’orthologue Tshz1 chez l’ancêtre du poisson zèbre existait ou non avant l’événement/les événements WGD, et si tel est le cas, si Tshz1b a été perdu par la suite au fil du temps en raison d’un réarrangement chromosomique.

Chez les mouches à fruits

Drosophila melanogaster est connu pour posséder un gène de la famille Tshz, communément appelé Tsh ou T Shirt, et est connu pour être orthologue à la famille de gènes Tshz chez les humains et d'autres vertébrés. Tsh s'est avéré impliqué dans l'activité de liaison à l'ADN et plusieurs aspects du développement, y compris la formation des structures de la tête et le développement de la charnière des ailes. D'autres processus importants dans lesquels Tsh est impliqué comprennent l'identité segmentaire, la structuration dorsale/ventrale et le développement de l'œil composé. De plus, Tsh a été utilisé comme gène test pour créer des méthodes plus rationalisées pour déterminer la position des éléments activateurs en raison de son grand ratio d' ARN non codants . Bien que éloigné des humains, la présence d'un gène de la famille Tshz chez D. melanogaster suggère que cette famille de gènes apparaît tôt dans la lignée évolutive des organismes modernes, avant la divergence des eucaryotes vertébrés et invertébrés. Actuellement, aucun organisme non eucaryote n'est connu pour posséder un gène orthologue Tshz, mais plusieurs autres invertébrés, tels que Bactrocera latifrons et Ceratitis capitata ont des orthologues Tsh connus.

Lectures complémentaires

Cet article intègre un texte de la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis , qui est dans le domaine public .

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