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Protéine homéobox CDX-2

Localisation du gène ( souris ) Chr. Chromosome 5 (souris) Groupe 5 G3 | 5 86,86 cM Commencer 147 237 615 pb Fin 147 244 080 pb Profil d'expression de l'ARN Bgee Humain Souris (...

Localisation du gène ( souris )
Chromosome 5 (souris)
Chr.Chromosome 5 (souris)
Chromosome 5 (souris)
Localisation génomique de CDX2
Localisation génomique de CDX2
Groupe5 G3 | 5 86,86 cMCommencer147 237 615 pb
Fin147 244 080 pb
Profil d'expression de l'ARN
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Le sommet exprimé en
  • muqueuse du côlon transverse
  • rectum
  • duodénum
  • épithélium du côlon
  • muqueuse de l'iléon
  • muqueuse du côlon sigmoïde
  • appendice
  • muqueuse jéjunale
  • corps du pancréas
  • Îlot de Langerhans
Le sommet exprimé en
  • Cellule de Paneth
  • queue de l'embryon
  • crypte de Lieberkühn de l'intestin grêle
  • tendance primitive
  • cellule de crête neurale entérique migratrice
  • iléon
  • jéjunum
  • duodénum
  • Épithélium du gros intestin
  • côlon gauche
Données d'expression de référence supplémentaires
BioGPS
Données d'expression de référence supplémentaires
ontologie des gènes
Fonction moléculaire
  • Liaison spécifique à l'ADN de la région cis-régulatrice de l'ARN polymérase II
  • liaison à l'ADN
  • liaison spécifique à l'ADN
  • activité corépressive de la transcription
  • Activité des facteurs de transcription se liant à l'ADN
  • Activité de répresseur de transcription se liant à l'ADN, spécifique de l'ARN polymérase II
  • liaison à l'ADN double brin
  • Activité du facteur de transcription se liant à l'ADN, spécifique de l'ARN polymérase II
  • liaison du méthyl-CpG
  • liaison à l'ADN spécifique à la séquence de la région régulatrice de la transcription de l'ARN polymérase II
Composant cellulaire
  • complexe répresseur de transcription
  • nucléoplasme
  • chromosome nucléaire condensé
  • noyau
  • complexe contenant des protéines
processus biologique
  • processus de spécification des modèles
  • différenciation cellulaire
  • régulation de la transcription, matrice d'ADN
  • régulation de la somitogenèse
  • maintenance de la population de cellules souches somatiques
  • transport endosome vers lysosome
  • développement du placenta
  • régulation de la transcription par l'ARN polymérase II
  • développement de couches labyrinthiques
  • régulation négative de la transcription par l'ARN polymérase II
  • transcription par l'ARN polymérase II
  • transcription, matrice d'ADN
  • régulation positive de la transcription, matrice d'ADN
  • développement d'organismes multicellulaires
  • développement des vaisseaux sanguins
  • différenciation des cellules du trophectoderme
  • établissement ou maintien de la polarité apicale/basale des cellules épithéliales
  • régulation positive de la différenciation cellulaire
  • différenciation des cellules épithéliales intestinales
  • régulation positive de la prolifération des populations cellulaires
  • morphogenèse des organes animaux
  • spécification de l'axe antéro-postérieur
  • développement du blastocyste
  • spécification du schéma antérieur/postérieur
Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHumainSouris
Entrez

1045

12591

Ensemble

ENSG00000165556

ENSMUSG00000029646

UniProt

Q99626

P43241

RefSeq (ARNm)

NM_001265 NM_001354700

NM_007673

RefSeq (protéine)

NP_001256 NP_001341629

NP_031699

Lieu (UCSC)Chroniques 13 : 27,96 – 27,97 MoChronique 5 : 147,24 – 147,24 Mo
Recherche PubMed
Wikidata
Afficher/Modifier HumainSouris d'affichage/modification

protéine homéobox CDX-2 est une protéine codée chez l'humain par le gène CDX2 . Cette protéine est un facteur de transcription homéobox exprimé dans les noyaux des cellules épithéliales intestinales , joue un rôle essentiel dans le développement et le fonctionnement du système digestif . CDX2 fait partie du cluster de gènes ParaHox , un groupe de trois gènes de développement hautement conservés présents chez la plupart des vertébrés . Avec CDX1 et CDX4 , CDX2 est l'un des trois gènes apparentés à la région caudale du génome humain.

Fonction

À l'instar des deux autres gènes Cdx, CDX2 régule plusieurs processus essentiels au développement et au fonctionnement du tractus gastro-intestinal inférieur (du duodénum à l'anus) chez les vertébrés. Au cours du développement embryonnaire des vertébrés , CDX2 s'active dans les cellules endodermiques postérieures à l'estomac en développement . Ces cellules formeront l' épithélium intestinal . L'activité de CDX2 à ce stade est essentielle à la formation correcte de l'intestin et de l'anus CDX2 est également nécessaire au développement du placenta .

Plus tard au cours du développement, CDX2 est exprimé dans les cellules souches épithéliales intestinales, qui se différencient continuellement en cellules formant la muqueuse intestinale. Cette différenciation est dépendante de CDX2 comme l'illustrent des expériences où l'expression de ce gène a été invalidée ou surexprimée chez la souris. Les souris hétérozygotes pour CDX2 présentent des lésions intestinales dues à la différenciation des cellules intestinales en épithélium gastrique ; ce phénomène peut être considéré comme une forme de transformation homéotique . Inversement, la surexpression de CDX2 conduit à la formation d'épithélium intestinal dans l'estomac

Outre son rôle dans l'endoderme, CDX2 est également exprimé aux tout premiers stades du développement embryonnaire chez la souris et l'homme, marquant spécifiquement la lignée trophectodermique des cellules du blastocyste . Les cellules trophectodermiques contribuent à la formation du placenta .

Pathologie

L'expression ectopique de CDX2 a été rapportée chez plus de 85 % des patients atteints de leucémie myéloïde aiguë (LMA). L'expression ectopique de Cdx2 dans la moelle osseuse murine a induit une LMA chez la souris et a stimulé l'expression des gènes Hox dans les progéniteurs médullaires. CDX2 est également impliqué dans la pathogenèse de l'œsophage de Barrett , où il a été démontré que des composants du reflux gastro-œsophagien, tels que les acides biliaires, sont capables d'induire l'expression d'un programme de différenciation intestinale par la stimulation de NF-κB et de CDX2.

Biomarqueur du cancer intestinal

CDX2 est également utilisé en pathologie chirurgicale diagnostique comme marqueur de différenciation gastro-intestinale, en particulier colorectale.

Utilisation possible dans la recherche sur les cellules souches

Ce gène (ou plus précisément, son équivalent chez l'humain) a été proposé par le Conseil présidentiel de bioéthique comme solution à la controverse sur les cellules souches . Selon l'un des plans avancés, la désactivation de ce gène empêcherait la formation d'un embryon correctement organisé, permettant ainsi d'obtenir des cellules souches sans destruction d'embryon. Parmi les autres gènes proposés à cette fin figure Hnf4 , nécessaire à la gastrulation .

Interactions

Il a été démontré que CDX2 interagit avec EP300 , et PAX6 .

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